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15/03/09
Palavras-Chave: Bioinformática, Tecnologia aplicada.
Nos últimos anos ocorreu um crescimento quase que exponencial das pesquisas, resultados altos investimentos governamentais. Como uma espécie de "corrida" atrás de patentes de novas tecnologias.
A interdisciplinaridade da biologia e ciências da computação emerge da realização da racionalização dos estudos, onde assume processos que podem ser mais bem explanados e fundamentados, para as questões de natureza complexa dos processos biológicos.
Os primeiros modelos matemáticos de vias metabólicas foram desenvolvidos por inspiração e descobrimento, e subsequentemente usados para a checagem numérica dos princípios de conjectura. E definições quantitativas desenvolvidas para descrever o limite do fluxo da rota metabólica.
Os modelos têm uma significante limitação quando as redes metabólicas contam com numerosas reações reversíveis (ex. via das pentoses fosfato), onde extensivas compartimentalizações são consideradas, onde padrões metabólicos se indicam diferentes em outras condições, e quando também alguns passos bioquímicos não são totalmente conhecidos.
Dia após dia os laboratórios de diversas áreas necessitam de um profissional da área da bioinformática. A aplicabilidade das tecnologias são diversas. Podem compreende de redes "ômicas" e suas integrações as identificações filogenéticas. Estas resultam em pesquisa futuras mais pontuais e menores custos.
A globalização, mais do que nunca, chegou às muitas instituições de pesquisa, onde as integrações de seus dados estão ultrapassando o nível de redes nacionais para internacionais. O Brasil em seu contexto político e científico não deixa a deseja com seu corpo de pesquisadores. Atualmente, muitos brasileiros são convidados a irem para grandes centros de pesquisa de outros países.
Existem projetos que pretendem integrar de uma maneira tão confiável todos os mecanismos celulares, do DNA até sua expressão fenotípica. Programas como estes buscam responder questões que sem ajuda dos computadores talvez levassem mais de um século de pesquisa. Esta é a nova cara da evolução da pesquisa: dinâmica, rápida e pontual.
Referências(Bibliografia): Bailey, J. E. (1998) Mathematical modeling and analysis in biochemical engineering: past accomplishments and future opportunities. Biotechnol. Prog. 14, 8-20. Gibson, S. (2005) Curr Opion Plant Biol, 8, 93-102. Giersch, C. (2000) Mathematical modeling of metabolism. Curr. Opin. Plant Biol. 3, 249-253. Heinrich, R.; Rapoport, S. M. & Rapoport, T. A. (1977) Progr. Biophys. Mol. Boil. 32, 1-83. Heinzle, E.; Matsuda, F.; Miyagawa, H.; Wakasa, K. and Nishioka, T. (2007) Estimation of metabolic fluxes, expression levels and metabolite dynamics of a secondary metabolic pathway in potato using label pulse-feeding experiments combined with kinectic network modeling and simulation. The Plant of Journal, 50, 176-187. Hood, L. (2003) Systems biology: integrating technology, biology, and computation. Mechanisms of Ageing and Development, 124, 9-16. Kacser, H. & Burns, J. A. (1973) In rate control of biological process (ed., Davies, D. D.) Cambridge University Press, Cambridge, 65-104. Kusano, M. et al. (2007) Unbiased characterization of genotype-dependent metabolic regulations by metabolomic approach in Arabidopsis thaliana. BMC Systems Biology, 53. Lange, B. M. (2006) Integrative analysis of metabolic networks: form peaks to flux models?. Curr. Opin. in Plant Biology, 9, 220-226. Martins, A.M.; Camacho D.; Shuma, J.; Sha, W.; Mends, P.; Shulaev, V. (2004) A system biology study of two distinct growth phases of Saccharomyces cerevisae cultures. Curr Genomics, 5, 649-663. Meyer, R. C. et al. (2007) The metabolic signature related to high plant growth rate in Arabidopsis thalina. PNAS, 104, 4759-4764. Neilsen, J. (1998) Metabolic engineering: techniques for analysis of tagets for genetic manipulations. Biotechnol. Bioeng. 58, 125-132. Stephanopoulos, G.N., Aristidou, A. A. and Nielsen, J (1998) Metabolic Engineering: Principles and Methodologies. San Diego, Ca, USA; Academic Press. Tohge, T. et al. (2005) Functional genomic by integrated analysis of metabolome and transcriptome factor. Plant J, 42, 218-235. Urbanczyk-Wochiniak, E. et al (2003) Parallel analysis of transcript and metabolic profile: a new approach in systems biology. EMBO Rep., 4, 989-993. Weckwerth, W.; Loureiro, M.E.; Wenzel, K.; Fiehn, O. (2004) Differential metabolic networks unravel the effects of silent plant phenotypes. Proc Natl Acad of Sci USA, 101, 7809-7814. Westerhoff, H. V. & Palson, B. O. (2004) The evolution of molecular biology into systems biology. Nature Biotec. 22, 1249-1252.
Informações sobre o(a) autor(a)
Nome: Danilo Pinho de Almeida
E-mail: dalmeida@ime.usp.br
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